网络药理学（network pharmacology）是一种综合应用生物信息学、系统生物学、网络分析学等多学科交叉的研究方法，用于探索药物与靶标、通路和疾病之间的相互作用及其作用机制。网络药理学所用到的软件和数据库非常丰富，以下是一些常用的软件和数据库：

软件：

(资料图)

Cytoscape：用于可视化网络结构和拓扑分析的软件。

STITCH：用于预测药物与蛋白质、代谢物等之间的相互作用的软件。

String：用于预测蛋白质相互作用网络的软件。

PharmMapper：用于预测药物与蛋白质之间的相互作用的软件。

TCMSP：用于预测中药与蛋白质之间的相互作用的软件。

Bioinformatics Toolbox：用于生物信息学数据分析的Matlab工具箱。

数据库：

PubChem：包含药物和化合物的结构、属性等信息的数据库。

DrugBank：包含药物的结构、作用机制、药代动力学等信息的数据库。

TCMID：包含中药与疾病、靶标等相关信息的数据库。

KEGG：包含生物通路和代谢通路等信息的数据库。

Reactome：包含人类生物通路和反应等信息的数据库。

HPRD：包含人类蛋白质互作网络等信息的数据库。

这些软件和数据库可以帮助研究人员进行药物靶点预测、药物作用机制探索、生物通路分析等任务，从而加速新药研发和发现。